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Feb 2024: 📝🎉 用于探索时间和其它发育信号的软件包ShinyTempSignal发表于Journal of Genetics and Genomics期刊 (Links: article, JGG遗传学报公众号报道),恭喜詹历、罗晓、谢玟琴和朱炫安(2018级生信本科生)。

Jan 2024: 发表一篇专刊Single-Cell and Spatial-Omics in Delineating Immune-Related Diseases的Editorial文章,恭喜温少迪。

Jan 2024: 周烺的文章(Briefings in Bioinformatics 2022)入选ESI高被引论文。

Dec 2023: 陆军军医大学刘迪博士生到本课题组进修。

Nov 2023: 余光创入选全球高被引科学家,南方医科大学十年来实现零突破。

Nov 2023: 李俊睿(八年制临床医学)加入课题组。

Nov 2023: 恭喜周烺获得2023年硕士研究生国家奖学金。

Oct 2023: 余光创入选全球前2%顶尖科学家榜单(World’s Top 2% Scientists)“终身科学影响力”(career-long impact)(全球排名36188)和“年度科学影响力”(single recent year impact)排行榜(全球排名744)。生物信息领域中国地区学者终身科学影响力排名第3,年度科学影响力排名第1。

Sep 2023: 余光创受邀Wiley科研访谈

Sep 2023: 🌹 朱鸿远(博士生)加入课题组。

Aug 2023: 🌹 温少迪(博士生)通过联合培养加入课题组。

Jul 2023: 博士后徐双斌在第一届CGM线下沙龙做学术报告。

Jul 2023: 佛山市第一人民医院郑慧敏博士后到本课题组进修。

Jul 2023: 🌹 唐文丽硕士毕业后留在课题组工作。

Jun 2023: 🌠🎉 恭喜唐文丽荣获南方医科大学2023届“优秀毕业研究生”荣誉称号。

Jun 2023: 📝🎉 通过微生物组预测代谢物的软件包MMINP发表于Gut Microbes期刊 (Links: article, TandF学术公众号报道),恭喜唐文丽。

Jun 2023: 🎉 2022年影响因子发布,The Innovation期刊获得首个影响因子 (32.1,11月校正后为33.1),课题组发表的文章 为期刊的影响因子贡献了9+分。

Jun 2023: 课题组进行K歌团建,现有成员、往届毕业学生和今年入学的新生一共23人,齐聚一堂,欢唱6个小时。

May 2023: 余光创在2023肠道大会iMeta作者论坛上作特邀报告(PPT)。

May 2023: 🎉 恭喜吴天志顺利通过博士生答辩,恭喜郭平凡和唐文丽顺利通过硕士生答辩。

May 2023: 余光创在第九届全国计算生物与生物信息学大会上作特邀报告。

Apr 2023: 余光创在首届TICSSO国际单细胞及空间组学大会上作报告,并主持分论坛5(单细胞科研探索创新论坛)。

Apr 2023: 🌹 祝贺王芮和邓琳两位同学成功上岸,加入课题组。

Mar 2023: 祝贺《R实战:系统发育树的数据集成操作及可视化》预售当日飙升京东计算机与互联网畅销书TOP 1,首印3000册两日内脱销。

Mar 2023: 🎉 余光创入选爱思唯尔2022年中国高被引学者(证书

Mar 2023: 🌹 刘秉东(博士后)通过联合培养加入课题组。

Mar 2023: 🌹 祝贺廖俞凡(初试第一名)通过研究生第一轮复试,加入课题组。

Mar 2023: 📝🎉 用于微生物组的软件包MicrobiotaProcess发表于The Innovation期刊 (Links: article, TheInnovation创新公众号报道),恭喜徐双斌。

Feb 2023: 📝🎉 专刊《Computational and systematic analysis of multi-omics data for drug discovery and development》发表编委社论文章,成功收关。

Jan 2023: 余光创申请的教学项目,“应用型生物信息学专项人才培养计划(特色班)”,获得2022年广东省高校教学质量与教学改革工程建设项目立项。

Jan 2023: 🎉 陈玫君被录取为硕博连读研究生。

Dec 2022: 软件著作权获批:

  • “多序列比对和相关数据的可视化探索工具–ggmsa软件[简称:ggmsa]1.2.3”(软著登字第10529672号)。

Nov 2022: 软件著作权获批:

  • “GeoTcgaDat软件[简称:GeoTcgaData]1.1.1”(软著登字第10523614号)。

Oct 2022: 两项软件著作权获批:

  • “基于图形语法的和弦图可视化软件包-ggcircos软件[简称:ggcircos]V1.0”(软著登字第10352956号)
  • “MOBEx–多组学整合探索生物标记物云平台[简称:MOBEx]V1.0”(软著登字第10352924号)

Oct 2022: 📝🎉 clusterProfiler4.0版本(link)引用过千,这也是The Innovation期刊首篇引用过千的文章,同时也是YuLab以南方医科大学为通讯单位所发表的文章中首篇引用过千的文章。

Oct 2022: 恭喜戴泽翰博士顺利通过博士后答辩!

Oct 2022: 📝🎉 使用ChIPseeker分析表观组学数据的protocol文章发表在Current Protocols期刊,(link),恭喜王倩雯和利铭。

Oct 2022: 余光创入选全球前2%顶尖科学家榜单(World’s Top 2% Scientists)“终身科学影响力”(career-long impact)和“年度科学影响力”(single recent year impact)排行榜(link 1 & 2)。

Oct 2022: 恭喜吴天志获得博士研究生国家奖学金。

Sep 2022: 提出用于系统发育树及相关数据存储与可视化的数据结构,文章发表于iMeta期刊 (Links: article, iMeta公众号报道),恭喜徐双斌。

Sep 2022: 🌹 欢迎利铭和罗晓加入YuLab,两人均通过推免进入本课题组。

Aug 2022: 余光创发表专著《Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Treess (1st edition)》,由Chapman and Hall/CRC出版社出版 doi: 10.1201/9781003279242

Aug 2022: 课题组基于公共测序数据,挖掘铜绿假单胞菌的毒素-抗毒素系统,成果发表在Fontiers in Microbiology期刊 (link),恭喜戴泽翰。

Aug 2022: 课题组基于癌症干性识别索拉非尼的耐药机制,成果发表在Frontiers in Oncology期刊 (link),恭喜冯婷泽、吴天志和周烺。

Jul 2022: 🌠🎉 恭喜冯婷泽和周烺荣获南方医科大学2022届“优秀毕业研究生”荣誉称号。

Jul 2022: ggmsa包实现了多种可视化方法用于探索多重序列比对结果,并可与ggtree对接使用,成果发表在Briefings in Bioinformatics期刊 (link),恭喜周烺和冯婷泽。

Jun 2022: 团队第一批研究生毕业,恭喜徐双斌获得博士学位,恭喜冯婷泽和周烺获得硕士学位。

May 2022: 可视化专刊Biomedical Data Visualization: Methods and Applications 15篇文章,形成电子书集合,可在专刊主页下载。

Apr 2022: 为可视化专刊Biomedical Data Visualization: Methods and Applications发表一篇Editorial文章,恭喜吴天志。

Apr 2022: 余光创入选爱思唯尔2021年中国高被引学者(证书)。

Mar 2022: 余光创荣获南方医科大学2020学年教学优秀一等奖。

Jan 2022: 恭喜陈玫君在2020-2021学年评优中,荣获“优秀研究生”和“优秀研究生骨干”荣誉称号。

Jan 2022: 恭喜唐文丽在2020-2021学年评优中,荣获“优秀研究生”荣誉称号。

Jan 2022: 恭喜徐双斌荣获第四届“南方医科大学基础医学学术年会-青年优秀论文评选”优秀奖。

Dec 2021: clusterProfiler 2012年发表在OMICS上的文章,被中国科学技术信息研究所列为“2011-2021我国高被引论文中被引次数最高的10篇国际论文”(来源:2021年中国科技论文统计报告)。

Dec 2021: 恭喜陈玫君在2021年南方医科大学实验室安全微视频创作大赛中荣获二等奖。

Nov 2021: ggbreak包实现了与ggplot2语法无缝衔接的坐标轴截断功能,发表在Frontiers in Genetics期刊 (link), 恭喜徐双斌和陈玫君。

Oct 2021: 余光创入选全球前2%顶尖科学家榜单(World’s Top 2% Scientists)“终身科学影响力”(career-long impact)和“年度科学影响力”(single recent year impact)排行榜(link)。

Oct 2021: 三年级硕士生周烺在Bioconductor亚洲区年会的Workshop环节介绍使用ggmsa可视化和探索多重序列比对。

Oct 2021: 恭喜徐双斌和郭平凡分别获得博士、硕士研究生国家奖学金。

Sep 2021: ggtreeExtra包在环形布局上实现了多维数据的整合可视化,发表在Molecular Biology and Evolution期刊 (link), 恭喜徐双斌。

Sep 2021: 🌹 欢迎李林、谢子敬和谢汶琴加入YuLab。恭喜汶琴获得推免生奖学金。

Aug 2021: clusterProfiler发布4.0版本,文章发表于The Innovation期刊 (Links: article, TheInnovation创新公众号报道),恭喜吴天志。

Jun 2021: 陈玫君同学参加南方医科大学学生抗疫服务队,支援广州市白云区大规模核酸采样。

Jun 2021: 课题组开发的检索新冠疫情的nCov2019包发表在PeerJ期刊上(link),恭喜吴天志。

May 2021: 课题组公众号“YuLabSMU”入选2020年度科研团队公众号Top10

Apr 2021: 余光创入选爱思唯尔2020年中国高被引学者(证书)。

Dec 2020: 余光创于2017年发表在Methods in Ecology and Evolution上的ggtree文章,入选MEE期刊创刊十周年10篇代表作

Oct 2020: 余光创入选全球前2%顶尖科学家榜单(World’s Top 2% Scientists)中的“年度影响力”榜单

Oct 2020: 余光创受邀请在Bioconductor亚洲区年会上做专题报告,介绍系统发育数据整合与可视化方面的工作;二年级博士生徐双斌在Workshop环节介绍使用课题组开发的MicrobiotaProcess分析宏基因组数据。

Sep 2020: 🌹 欢迎吴天志、唐文丽、陈玫君和詹历加入YuLab。

Mar 2020: 受William Pearson教授的邀请,在Current Protocols in Bioinformatics期刊上发表ggtree文章,通过实例介绍ggtree的使用 (link)

Feb 2020: treeio包解决系统发育树及相关数据的输入与输出问题,成果发表在Molecular Biology and Evolution期刊 (link)。

Jan 2020: 《Stem Cell Transcriptional Networks》第二版出版,余光创撰写了其中的第十一章《Gene Ontology Semantic Similarity Analysis Using GOSemSim》(link)。

Sep 2019: 🌹 YuLab有了第一批研究生,欢迎徐双斌、周烺、冯婷泽和郭平凡。欢迎博士后戴泽翰。

Jan 2019: 余光创受邀,为南丹麦大学博士生课程,BMB209: Workshops in Applied Bioinformatics,授课。

Dec 2018: 提出两种通用的方法用于系统发育相关数据的整合与可视化,发表在Molecular Biology and Evolution期刊 (link)。

Sep 2018: 🚀✨🎉 余光创以第三层次人才引进到南方医科大学。Hello YuLab!